Bioinformaticien (ne) de recherche Niveau 4 (Dr Lavallée)
Top Benefits
About the role
Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront d’innombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes, soit plus de 295 chercheuses et chercheurs, dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines d’expertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine, cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale, clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.
**Projet -**Professionnel en analyse de génomes complets des tumeurs pédiatrique par séquençage de troisième génération
Le laboratoire du Dr Vincent-Philippe Lavallée, (https://www.lavalleelab.com/) clinicien-chercheur et directeur scientifique de la méta-plateforme de génomique intégrée du CHU Sainte-Justine, utilise des technologies de séquençage de nouvelle génération, dont le séquençage par Nanopore, pour améliorer le diagnostic et la caractérisation moléculaire des cancers pédiatriques (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2025.10.02.25336569v1). La recherche menée au laboratoire porte également sur l’utilisation de biopsies liquides afin de détecter et suivre les marqueurs tumoraux de façon non invasive. Un volet important de la recherche porte sur la compréhension de l’hétérogénéité tumorale, un facteur clé dans la progression et la résistance aux traitements.
Grâce à son rôle dans les projets Leucégène et SIGNATURE, le Dr Lavallée a accès à de large cohortes de patients adultes (AML) et pédiatriques, ce qui permet d’intégrer la recherche clinique et génomique à grande échelle afin d’identier de nouvelles altérations responsables du développement de ces cancers.
L’équipe, multidisciplinaire et hautement collaborative, travaille étroitement avec la clinique et la plateforme de génomique pour accélérer le transfert des découvertes vers des applications concrètes pour les patients.
Tes défis
La personne sélectionnée aura l’opportunité d’œuvrer dans le domaine des technologies émergentes en -omics appliquées aux cancers pédiatriques, dont la leucémie. Cette personne sera amenée à analyser et interpréter des données de cohortes utilisant le séquençage provenant de diverses méthodes, en particulier par génome à longues lectures Nanopore tumoral et germinal. Le travail consistera à caractériser les altérations somatiques (SNV, CNV, fusion) dans les régions codantes et non codantes en travaillant à partir de génomes de référence et d’assemblages de novo. Les données Omiques autres telles que le méthylome et le transcriptome seront à intégrer aux analyses afin de caractériser en détail des groupes de tumeurs. La recrue travaillera au développement et à la maintenance de l’infrastructure informatique du laboratoire, incluant la gestion des données, ainsi qu’à la gestion et la coordination du travail en bio-informatique avec l’équipe en place. Le/la titulaire effectuera aussi la coordination du travail local au laboratoire en bio-informatique en lien avec les approches -omics effectuées dans le laboratoire. Les tâches incluront également l’analyse de données pour des projets ciblés.
Sous la supervision du directeur du laboratoire et du personnel de recherche sénior, le/la titulaire de ce poste a la responsabilité d’effectuer les tâches suivantes :
-
Analyser et interpréter de façon indépendante des jeux de données tels que des génomes complets, générer des figures et publier les résultats;
-
Développer l’infrastructure informatique du laboratoire;
-
Implémenter les pipelines couramment utilisés en génomique;
-
Organiser, prioriser et lancer les tâches sur les serveurs;
-
Participer à la gestion de l’entreposage des données;
-
Devenir expert des contrôles de qualités et des méthodes d’analyses des données de séquençage par Nanopore;
-
Faire le lien avec le laboratoire humide et avec la plateforme de séquençage pour les aspects relatifs à l’acquisition des données;
-
Collaborer avec les groupes de recherche du centre de recherche du CHU Sainte-Justine, du groupe Signature et du groupe Leucegene et présenter des résultats sur des questions biologiques précises;
-
Collaborer étroitement avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyse pour différents projets ;
-
Servir de personne ressource disponible et enseigner certains aspects de la bioinformatique aux nouveaux membres du laboratoire et aux collaborateurs;
Tes acquis et talents
- Doctorat en bio-informatique ou dans un domaine connexe tel que la biologie moléculaire, combiné à une solide expérience de recherche appliqué à la génomique des cancers;
- Une maitrise avec expérience professionnelle substantielle dans le domaine d’intérêt sera considérée.
- Démontrer une habilité à travailler en bio-informatique dans divers domaines de recherche
- Expertise démontrée en génomique à large échelle.
- Expérience en programmation et en calculs de haute performance (R, python, Linux/Unix, Alliance de recherche numérique du Canada);
- Faire preuve de leadership et d’autonomie dans son travail;
- Aptitudes de coordination ;
- Intérêt pour le travail en groupe et l’enseignement
- Capacité à maintenir de très bonnes relations interpersonnelles;
- Curiosité face aux nouvelles technologies
- Grande capacité à travailler selon des dates de tombées serrées
- Maîtrise de l’anglais parlé et écrit, aptitude en français parlé.
Notre offre
- Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR) -Échelle****salariale: Niveau 4 - entre 32.91 $/hr et 48.89$/hr -Chercheur****responsable: Dr Vincent-Philippe Lavallée -Poste: Régulier à temps complet (35 heures par semaine) -**Date d’entrée en fonction :**Dès que possible
Avis important
Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».
Veuillez utiliser notre site de recrutement pour postuler en ligne. Seuls les candidats retenus seront contactés.
Fin de l'affichage : 23 mars 2026
Autres avantages
- Une conciliation travail et vie personnelle :
- Plan de vacances avantageux
- 20 jours de vacances par année, 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
- 13 jours fériés
- 9,6 jours de maladie par année
- Congé de maternité, de paternité et d’adoption
- Des avantages collectifs concurrentiels :
- Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
- Assurances collectives pour vous et votre famille
- Programme d’aide aux employés et à leur famille
- Des établissements facilement accessibles
- Station de métro Université-de-Montréal, lignes d’autobus et grands axes routiers à proximité
- Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité
- Située dans le quartier Côte-des-Neiges
- Des services sur place pour vous simplifier la vie:
- Centre de la petite enfance Sainte-Justine
- Nettoyeur et service de couture
- Activités sportives
- Service alimentaire qui encourage l’agriculture biologique et locale
- Livraison de paniers de légumes biologiques
Remarques
Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.
About CHU SAINTE-JUSTINE
The CHU Sainte-Justine is Quebec's only health care establishement exclusively dedicated to children, adolescents and mothers.
Our health professionals minister care and offer different services in two locations in Montreal : the CHU Sainte-Justine on chemin de la Côte-Sainte-Catherine and the Centre de réadaptation Marie Enfant (CRME), on Bélanger street E.
The CHU Sainte-Justine, it's: (each year)
3 530 births 83 271 visits to the emergency About 222 984 visits in outpatient clinics The CHU Sainte-Justine staff, it's: 5 457 employees including 1 532 nurses 520 doctors and pharmacists 204 researchers 411 volunteers 4 416 trainees and students BECOME A PART OF OUR BIG TEAM!
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Bioinformaticien (ne) de recherche Niveau 4 (Dr Lavallée)
Top Benefits
About the role
Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront d’innombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes, soit plus de 295 chercheuses et chercheurs, dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines d’expertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine, cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale, clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.
**Projet -**Professionnel en analyse de génomes complets des tumeurs pédiatrique par séquençage de troisième génération
Le laboratoire du Dr Vincent-Philippe Lavallée, (https://www.lavalleelab.com/) clinicien-chercheur et directeur scientifique de la méta-plateforme de génomique intégrée du CHU Sainte-Justine, utilise des technologies de séquençage de nouvelle génération, dont le séquençage par Nanopore, pour améliorer le diagnostic et la caractérisation moléculaire des cancers pédiatriques (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2025.10.02.25336569v1). La recherche menée au laboratoire porte également sur l’utilisation de biopsies liquides afin de détecter et suivre les marqueurs tumoraux de façon non invasive. Un volet important de la recherche porte sur la compréhension de l’hétérogénéité tumorale, un facteur clé dans la progression et la résistance aux traitements.
Grâce à son rôle dans les projets Leucégène et SIGNATURE, le Dr Lavallée a accès à de large cohortes de patients adultes (AML) et pédiatriques, ce qui permet d’intégrer la recherche clinique et génomique à grande échelle afin d’identier de nouvelles altérations responsables du développement de ces cancers.
L’équipe, multidisciplinaire et hautement collaborative, travaille étroitement avec la clinique et la plateforme de génomique pour accélérer le transfert des découvertes vers des applications concrètes pour les patients.
Tes défis
La personne sélectionnée aura l’opportunité d’œuvrer dans le domaine des technologies émergentes en -omics appliquées aux cancers pédiatriques, dont la leucémie. Cette personne sera amenée à analyser et interpréter des données de cohortes utilisant le séquençage provenant de diverses méthodes, en particulier par génome à longues lectures Nanopore tumoral et germinal. Le travail consistera à caractériser les altérations somatiques (SNV, CNV, fusion) dans les régions codantes et non codantes en travaillant à partir de génomes de référence et d’assemblages de novo. Les données Omiques autres telles que le méthylome et le transcriptome seront à intégrer aux analyses afin de caractériser en détail des groupes de tumeurs. La recrue travaillera au développement et à la maintenance de l’infrastructure informatique du laboratoire, incluant la gestion des données, ainsi qu’à la gestion et la coordination du travail en bio-informatique avec l’équipe en place. Le/la titulaire effectuera aussi la coordination du travail local au laboratoire en bio-informatique en lien avec les approches -omics effectuées dans le laboratoire. Les tâches incluront également l’analyse de données pour des projets ciblés.
Sous la supervision du directeur du laboratoire et du personnel de recherche sénior, le/la titulaire de ce poste a la responsabilité d’effectuer les tâches suivantes :
-
Analyser et interpréter de façon indépendante des jeux de données tels que des génomes complets, générer des figures et publier les résultats;
-
Développer l’infrastructure informatique du laboratoire;
-
Implémenter les pipelines couramment utilisés en génomique;
-
Organiser, prioriser et lancer les tâches sur les serveurs;
-
Participer à la gestion de l’entreposage des données;
-
Devenir expert des contrôles de qualités et des méthodes d’analyses des données de séquençage par Nanopore;
-
Faire le lien avec le laboratoire humide et avec la plateforme de séquençage pour les aspects relatifs à l’acquisition des données;
-
Collaborer avec les groupes de recherche du centre de recherche du CHU Sainte-Justine, du groupe Signature et du groupe Leucegene et présenter des résultats sur des questions biologiques précises;
-
Collaborer étroitement avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyse pour différents projets ;
-
Servir de personne ressource disponible et enseigner certains aspects de la bioinformatique aux nouveaux membres du laboratoire et aux collaborateurs;
Tes acquis et talents
- Doctorat en bio-informatique ou dans un domaine connexe tel que la biologie moléculaire, combiné à une solide expérience de recherche appliqué à la génomique des cancers;
- Une maitrise avec expérience professionnelle substantielle dans le domaine d’intérêt sera considérée.
- Démontrer une habilité à travailler en bio-informatique dans divers domaines de recherche
- Expertise démontrée en génomique à large échelle.
- Expérience en programmation et en calculs de haute performance (R, python, Linux/Unix, Alliance de recherche numérique du Canada);
- Faire preuve de leadership et d’autonomie dans son travail;
- Aptitudes de coordination ;
- Intérêt pour le travail en groupe et l’enseignement
- Capacité à maintenir de très bonnes relations interpersonnelles;
- Curiosité face aux nouvelles technologies
- Grande capacité à travailler selon des dates de tombées serrées
- Maîtrise de l’anglais parlé et écrit, aptitude en français parlé.
Notre offre
- Syndicat des employés du Centre de recherche du CHU Sainte-Justine (SECR) -Échelle****salariale: Niveau 4 - entre 32.91 $/hr et 48.89$/hr -Chercheur****responsable: Dr Vincent-Philippe Lavallée -Poste: Régulier à temps complet (35 heures par semaine) -**Date d’entrée en fonction :**Dès que possible
Avis important
Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».
Veuillez utiliser notre site de recrutement pour postuler en ligne. Seuls les candidats retenus seront contactés.
Fin de l'affichage : 23 mars 2026
Autres avantages
- Une conciliation travail et vie personnelle :
- Plan de vacances avantageux
- 20 jours de vacances par année, 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
- 13 jours fériés
- 9,6 jours de maladie par année
- Congé de maternité, de paternité et d’adoption
- Des avantages collectifs concurrentiels :
- Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
- Assurances collectives pour vous et votre famille
- Programme d’aide aux employés et à leur famille
- Des établissements facilement accessibles
- Station de métro Université-de-Montréal, lignes d’autobus et grands axes routiers à proximité
- Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité
- Située dans le quartier Côte-des-Neiges
- Des services sur place pour vous simplifier la vie:
- Centre de la petite enfance Sainte-Justine
- Nettoyeur et service de couture
- Activités sportives
- Service alimentaire qui encourage l’agriculture biologique et locale
- Livraison de paniers de légumes biologiques
Remarques
Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.
About CHU SAINTE-JUSTINE
The CHU Sainte-Justine is Quebec's only health care establishement exclusively dedicated to children, adolescents and mothers.
Our health professionals minister care and offer different services in two locations in Montreal : the CHU Sainte-Justine on chemin de la Côte-Sainte-Catherine and the Centre de réadaptation Marie Enfant (CRME), on Bélanger street E.
The CHU Sainte-Justine, it's: (each year)
3 530 births 83 271 visits to the emergency About 222 984 visits in outpatient clinics The CHU Sainte-Justine staff, it's: 5 457 employees including 1 532 nurses 520 doctors and pharmacists 204 researchers 411 volunteers 4 416 trainees and students BECOME A PART OF OUR BIG TEAM!